O financiamento dos medicamentos é de responsabilidade do Ministério da Saúde, que realiza sua aquisição e repasse aos Estados ou Municípios, de acordo com o planejamento anual. A Secretaria de Estado da Saúde de São Paulo – SES/SP, por sua vez recebe, armazena e distribui os medicamentos adquiridos pelo MS aos Departamentos Regionais de Saúde – DRS, municípios paulistas e hospitais da rede.

A SES/SP também realiza a aquisição de medicamentos, como por exemplo, anfotericina b lipossomal 50 mg e dapsona 100mg, e os demais medicamentos, quando necessário.