Criado em 2004, o Boletim Epidemiológico Paulista (BEPA) é uma publicação técnico-científica da Coordenadoria de Controle de Doenças (CCD), órgão da Secretaria de Estado da Saúde de São Paulo (SES-SP) – responsável pelo planejamento e execução das ações de promoção à saúde e prevenção de quaisquer riscos, agravos e doenças nas diversas áreas de abrangência do Sistema Único de Saúde (SUS). Ao longo de 20 anos foram publicadas 221 edições. Neste período, o BEPA se consolidou como um importante veículo para divulgação de artigos científicos originais, normas e informes técnicos detalhados das ações programáticas de vigilância em saúde em âmbito nacional e internacional.

O BEPA passou por um processo de inovação para garantir maior dinamismo enquanto ferramenta para disseminação de informações, promovendo atualização e o aprimoramento técnico-científico dos profissionais e instituições de saúde, além de incentivar a produção e divulgação de trabalhos realizados pelas redes pública e privada de São Paulo e do Brasil. É nesse contexto que, mesmo sendo um periódico que carrega em seu nome um estado brasileiro, ele possui abrangência nacional, por trazer informes técnicos, epidemiológicos e temas relevantes para todo o país. São Paulo, como polo de pesquisa de destaque, contribui com artigos de relevância nacional e sua publicação é gratuita. 

Adequações estão sendo implementadas continuamente para atender aos critérios dos principais indexadores e garantir acesso livre e irrestrito aos artigos publicados. Todas as publicações do periódico possuem DOI, ISSN, informações de citação, datas de submissão, aceitação e publicação, E-location e licença Creative Commons (CC By 4.0).